Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXC12P31275 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXC12P31275 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms