Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA11P31270 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms