Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXA7P31268 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXA7P31268 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXA7P31268 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms