Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TSPOP30536 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TSPOP30536 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms