Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRPAP1P30533 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRPAP1P30533 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms