Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC27P30260 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDC27P30260 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDC27P30260 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDC27P30260 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDC27P30260 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms