Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGA1P29973 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGA1P29973 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms