Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD1P29536 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMOD1P29536 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms