Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GCAP28676 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCAP28676 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCAP28676 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCAP28676 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCAP28676 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GCAP28676 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GCAP28676 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GCAP28676 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCAP28676 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCAP28676 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms