Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PEX2P28328 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PEX2P28328 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PEX2P28328 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX2P28328 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX2P28328 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PEX2P28328 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms