Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARK3P27448 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARK3P27448 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARK3P27448 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARK3P27448 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARK3P27448 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARK3P27448 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARK3P27448 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARK3P27448 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms