Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PSMA4P25789 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSMA4P25789 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms