Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TNFSF4P23510 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms