Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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