Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC3P19447 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms