Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATF3P18847 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATF3P18847 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF3P18847 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF3P18847 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATF3P18847 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATF3P18847 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATF3P18847 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATF3P18847 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATF3P18847 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF3P18847 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF3P18847 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATF3P18847 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms