Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRAP18433 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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