Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NR2C1P13056 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NR2C1P13056 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms