Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LYL1P12980 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LYL1P12980 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LYL1P12980 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LYL1P12980 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms