Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COX6A1P12074 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COX6A1P12074 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms