Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLUP10909 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLUP10909 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLUP10909 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLUP10909 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLUP10909 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms