Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMIGD3P0DMS9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms