Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM6P0DI80 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM6P0DI80 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms