Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPM2P07951 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPM2P07951 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPM2P07951 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPM2P07951 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPM2P07951 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPM2P07951 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPM2P07951 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms