Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB4AP04350 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms