Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRB1P04280 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRB1P04280 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRB1P04280 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRB1P04280 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRB1P04280 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRB1P04280 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRB1P04280 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms