Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-7P01780 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms