Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHV3-11P01762 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHV3-11P01762 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms