Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD4P01730 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD4P01730 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD4P01730 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD4P01730 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD4P01730 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD4P01730 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms