Protein–RNA interactions for Protein: P01594

IGKV1-33, Immunoglobulin kappa variable 1-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-33P01594 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGKV1-33P01594 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms