Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFDP00746 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CFDP00746 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CFDP00746 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CFDP00746 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CFDP00746 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms