Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CBX7O95931 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBX7O95931 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBX7O95931 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CBX7O95931 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CBX7O95931 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CBX7O95931 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms