Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SIX6O95475 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SIX6O95475 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SIX6O95475 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms