Protein–RNA interactions for Protein: O95390

GDF11, Growth/differentiation factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF11O95390 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF11O95390 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF11O95390 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF11O95390 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF11O95390 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF11O95390 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms