Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBF1O95248 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBF1O95248 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBF1O95248 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBF1O95248 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBF1O95248 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBF1O95248 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBF1O95248 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms