Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM13AO94988 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM13AO94988 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms