Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP19O94966 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP19O94966 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP19O94966 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP19O94966 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP19O94966 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP19O94966 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP19O94966 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP19O94966 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP19O94966 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP19O94966 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP19O94966 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP19O94966 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP19O94966 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP19O94966 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP19O94966 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP19O94966 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP19O94966 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms