Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ABCC9O60706 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ABCC9O60706 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
ABCC9O60706 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
ABCC9O60706 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
ABCC9O60706 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC40.05■■■■■ 4
ABCC9O60706 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ABCC9O60706 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC9O60706 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ABCC9O60706 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ABCC9O60706 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC9O60706 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC9O60706 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC9O60706 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC9O60706 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ABCC9O60706 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms