Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPLO60437 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPLO60437 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPLO60437 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPLO60437 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPLO60437 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPLO60437 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPLO60437 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPLO60437 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPLO60437 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PPLO60437 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPLO60437 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PPLO60437 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPLO60437 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPLO60437 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms