Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SSNA1O43805 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SSNA1O43805 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms