Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STX6O43752 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STX6O43752 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STX6O43752 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STX6O43752 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STX6O43752 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STX6O43752 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms