Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD28O15084 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD28O15084 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms