Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3EO15041 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3EO15041 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms