Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
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