Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE40O14503 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms