Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIK3CDO00329 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CDO00329 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms