Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFKBIEO00221 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFKBIEO00221 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms