Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms