Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms