Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A6NL46 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A6NL46 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
A6NL46 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
A6NL46 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
A6NL46 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
A6NL46 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A6NL46 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
A6NL46 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
A6NL46 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms